Tarekat Naqsyabandiyah Khalidiyah Yayasan Prof. Dr. H. Kadirun Yahya melakukan kerjasama dengan sembilan Tarekat Naqsyabandiyah (TN) serumpun, yaitu tarekat yang memiliki sumber silsilah keguruan yang sama, yaitu sama-sama berasal dari jalur silsilah Sayyidi Syaikh Abdullah Afandi, Jabal Qubaisy Mekah. Kerja sama ini terbentuk melalui silaturahmi Syaikh -Syaikh Tarekat serumpun yang berlangsung pada tanggal 14 April 2003, di mana tarekat-tarekat serumpun yang bekerjasama adalah:
- TN Babussalam, Langkat, Sumatera Utara, Pimpinan Drs. H. Syaikh Hasyim Al-Syarwani
- TN Ponpes Labuhan Haji, Nanggroe Aceh Darussalam, Pimpinan Syaikh Amran Wali
- TN Tanjung Alam Bulaan, Koto Tabu, Batu Sangkar Sumatera Barat Pimpinan H. Syaikh Al Imam Ramali
- TN Ranjau Batu, Mandailing Natal, Sumatera Utara Pimpinan H.Syaikh Muhammad chaer
- TN Hutapungkut, Kotanopan, Mandailing Natal Sumatera Utara, Pimpinan Syaikh Syafi’i
- TN Bonjol, Pasaman, Sumatera Barat, Pimpinan Syaikh Taslim
- TN Kumpulan, Pasaman, Sumatera Barat, Pimpinan Syaikh Nasrul TK Sayidina Ibrahim
- TN Aek Libung Tapanuli Selatan, Sumatara Utara, Pimpinan H. Syaikh Husein
- TN Giri Kusumo, Semarang, Jawa Tengah, Pimpinan Drs. H. Syaikh Muhammad Zuhri.
Kerjasama tersebut dimaksudkan untuk membangun silaturrahmi dan sekaligus mendorong terciptanya kerukunan umat beragama pada umumnya, dan ukhuwah Islamiyah pada khususnya, di samping untuk bersama-sama membahas mengenai masalah-masalah ke-tarekat-an dalam forum seminar, sarasehan, loka karya dan lain-lain.
